较之老款桑塔纳3000车型，06款桑塔纳3000最大的变化在于其“心”。 在延续了1.8L排量的同时，06款桑塔纳3000的两款豪华车型更配备了新2.0L直列四缸2VQS多点电喷汽油机，以满足更多用户需要。先进的科技带来更加强劲出色的动力性能和更低的油耗，让“桑塔纳”这个黄金品牌在2.0L这个“黄金排量”的轿车市场也占据了稳固的一席之地。 06款桑塔纳3000所配备的两种排量的发动机属于闭环电子多点顺序喷射发动机。采用最新横流扫气技术，降低了进气温度，提高了进气量和充气效率，配合长弧形进气歧管和谐振式，使发动机在高速运转下仍能保持稳定的进气压力，功率的输出也就更加顺畅。先进的闭环电子控制燃油多点顺序喷射系统和BOSCH M3.8.3控制系统，可以实现对空气和燃油的分开测量和控制，在各种运行状态下都能精确计量出所需的进油量，以此确定点火提前角的大小，并且可以根据发动机状态（如启动、怠速、加速、环境温度、燃油品质等）随时对点火时刻进行修正，使得功率输出稳定、顺畅，使发动机性能始终保持高精度和高稳定性。两款发动机最值得称道之处便是其所采用的E-Gas电子油门技术，即电子节气门。传统的油门是通过机械式联动对节气门进行控制，而E-Gas采用电子信号通过控制器（ECU）来控制节气门开度，从而实现了更加精确的操控，大大增强了启动及加速感觉，提高了燃油经济性。 ECU采用BOSCH公司ME7.5 控制系统，针对中国市场及路况的特点，进行了全新匹配。E-Gas能统一协调并合理管理汽车各种瞬时情况（如加速超车、驱动打滑、空调开关等）对于发动机扭矩和输出功率的要求，使发动机在任何时间、地点、状态下都能够处于最佳、最合理的工况范围，既降低了油耗又使车辆行驶更平稳，从而进一步提升操控性和安全性。在紧急情况下（如发动机超速运转等），控制器可以自动适时关闭节气门，停止发动机工作，在保护发动机的同时也保护了驾乘人员的安全。